ここではロックマンX3のボス弱点をまとめています。
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８ボス
フローズンバッファリオ
パラスティックボムが弱点（エクスプローズホーネック入手）
アシッドシーフォース
フロストシールドが弱点（フローズンバッファリオ入手）
スクリューマサイダー
アシッドラッシュが弱点（アシッドシーフォース入手）
エレキテルナマズロス
トルネードファングが弱点（スクリューマサイダー入手）
シザーズシュリンプァー
トライアードサンダーが弱点（エレキテルナマズロス入手）
シャイニングタイガード
スピニングブレードが弱点（ジザーズシュリンプァー入手）
グラビティビートブード
レイスプラッシャーが弱点（シャイニングタイガード入手）
エクスプローズホーネック
バグホールが弱点（グラビティビートブード入手）
ナイトメアポリス
ヴァジュリーラ
フロストシールド、トライアードサンダーが弱点
マンダレーラ
トルネードファング、レイスプラッシャーが弱点
VAVAmk2
レイスプラッシャー、スピニングブレードが弱点
ドップラーステージ１
ナイトメアポリスを両方弱点武器で倒したか、倒してないかで出てくるボスが変わる。
ブレス・ディスポーサー
弱点武器で両方倒した場合。
レイスプラッシャー、トルネードファングが弱点
ゴッドカルマシーン０・イナリー
レイスプラッシャーが弱点
ドップラーステージ２
ここまでにVAVAを弱点武器で倒していれば、モスキータスが出る。
モスキータス
ゼロで倒すとセイバーが手に入る。
VAVAmk2
レイスプラッシャー、スピニングブレード
ボルトクラゲール
フロストシールドが弱点
ドップラーステージ３
ドップラー
アシッドラッシュが弱点
シグマステージ
シグマ
フロストシールドが弱点
カイザーシグマ
なし